Vi saa ham under opholdet i Kjøbenhavn offentliggjøre en artikel i byens store tidsskrift, hvori han gav en oversigt over sine landsmænds forsøk paa at skape en selvstændig norsk historieforskning. Denne artikel hadde redaktionen, en komite paa 15 lærde herrer, introducert med en meget forbeholden bemerkning om at «dens forfatter, som er en nordmand, ikke skarpere har karakterisert den mot Danmark fiendtlige retning og tone som hersker» i de kritiserte «Samlinger til det Norske Folks og Sprogs Historie». Her sigtes til justitiarius Bergs bekjendte tilbøielighet til at fremhæve den behandling Norge under unionen med Danmark blev til del som uretfærdig og tilsidesættende. Munch hadde vistnok indflettet en sætning om at Berg «i sin patriotisme er gaat vel vidt i harmfulde utfald mot Danmark og dets styrelse, og at han endog hertil synes at ha søkt anledning, hvor den likefrem ikke gaves». Men ellers tilføier han for egen regning at «enhver upartisk i almindelighet og naturligvis nordmændene i særdeleshet maa føle harme over de hyppige brud paa løfter og traktater hvori unionskongerne gjorde sig skyldige, fornemmelig over det sidste avgjørende magtsprog, hvorved Norge mistet sin selvstændighet og gjordes til en provins av Danmark». Rigtignok gir han i korte drag en forklaring paa forholdet som et utslag, ikke av den danske nations, men kun av den danske adels trang til at «fortære broderlandet».
Munchs stemning var ikke til at ta feil av. Den skinte ogsaa tydelig igjennem i den første selvstændige bok han utgav — hans «Norges, Sveriges og Danmarks Historie til Skolebrug», som forelaa aaret efter hjemkomsten.